Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Sdc4O35988 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Sdc4O35988 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Sdc4O35988 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Sdc4O35988 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Sdc4O35988 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Sdc4O35988 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Sdc4O35988 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Sdc4O35988 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,39■■□□□ 1,81
Sdc4O35988 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26,39■■□□□ 1,81
Sdc4O35988 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Sdc4O35988 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Sdc4O35988 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Sdc4O35988 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Sdc4O35988 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Sdc4O35988 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Sdc4O35988 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Sdc4O35988 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Sdc4O35988 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Sdc4O35988 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Sdc4O35988 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Sdc4O35988 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Sdc4O35988 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Sdc4O35988 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Sdc4O35988 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Sdc4O35988 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Sdc4O35988 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,23■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26,21■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,2■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,2■■□□□ 1,79
Sdc4O35988 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Sdc4O35988 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Sdc4O35988 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Sdc4O35988 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Sdc4O35988 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Sdc4O35988 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Sdc4O35988 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Sdc4O35988 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Sdc4O35988 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Sdc4O35988 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Sdc4O35988 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Sdc4O35988 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Sdc4O35988 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Sdc4O35988 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Sdc4O35988 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Sdc4O35988 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Sdc4O35988 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Sdc4O35988 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Sdc4O35988 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Sdc4O35988 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Sdc4O35988 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Sdc4O35988 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Sdc4O35988 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26,03■■□□□ 1,76
Sdc4O35988 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Sdc4O35988 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Sdc4O35988 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Sdc4O35988 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25,99■■□□□ 1,75
Sdc4O35988 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,99■■□□□ 1,75
Sdc4O35988 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Sdc4O35988 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Sdc4O35988 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Sdc4O35988 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Sdc4O35988 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Sdc4O35988 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Sdc4O35988 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Sdc4O35988 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Sdc4O35988 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Sdc4O35988 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Sdc4O35988 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Sdc4O35988 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Sdc4O35988 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Sdc4O35988 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Sdc4O35988 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Sdc4O35988 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Sdc4O35988 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Sdc4O35988 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Sdc4O35988 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Sdc4O35988 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Sdc4O35988 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Sdc4O35988 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Sdc4O35988 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Sdc4O35988 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Sdc4O35988 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Sdc4O35988 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Sdc4O35988 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Sdc4O35988 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms