Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20,22■□□□□ 0,83
Rnf5O35445 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20,21■□□□□ 0,83
Rnf5O35445 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20,21■□□□□ 0,83
Rnf5O35445 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20,21■□□□□ 0,83
Rnf5O35445 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Rnf5O35445 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Rnf5O35445 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,2■□□□□ 0,82
Rnf5O35445 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Rnf5O35445 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Rnf5O35445 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Rnf5O35445 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Rnf5O35445 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20,18■□□□□ 0,82
Rnf5O35445 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Rnf5O35445 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,17■□□□□ 0,82
Rnf5O35445 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20,16■□□□□ 0,82
Rnf5O35445 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Rnf5O35445 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20,16■□□□□ 0,82
Rnf5O35445 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Rnf5O35445 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Rnf5O35445 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20,14■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,13■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20,13■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20,12■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,11■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,1■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,1■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Rnf5O35445 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Rnf5O35445 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Rnf5O35445 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Rnf5O35445 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Rnf5O35445 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,04■□□□□ 0,8
Rnf5O35445 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,04■□□□□ 0,8
Rnf5O35445 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Rnf5O35445 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Rnf5O35445 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,79
Rnf5O35445 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20,01■□□□□ 0,79
Rnf5O35445 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Rnf5O35445 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Rnf5O35445 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Rnf5O35445 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20■□□□□ 0,79
Rnf5O35445 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Rnf5O35445 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Rnf5O35445 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Rnf5O35445 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,98■□□□□ 0,79
Rnf5O35445 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Rnf5O35445 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19,98■□□□□ 0,79
Rnf5O35445 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Rnf5O35445 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Rnf5O35445 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Rnf5O35445 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Rnf5O35445 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Rnf5O35445 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Rnf5O35445 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Rnf5O35445 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Rnf5O35445 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,91■□□□□ 0,78
Rnf5O35445 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Rnf5O35445 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Rnf5O35445 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Rnf5O35445 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Rnf5O35445 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19,89■□□□□ 0,77
Rnf5O35445 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Rnf5O35445 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Rnf5O35445 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Rnf5O35445 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Rnf5O35445 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Rnf5O35445 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19,86■□□□□ 0,77
Rnf5O35445 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19,85■□□□□ 0,77
Rnf5O35445 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Rnf5O35445 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,78■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19,77■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19,77■□□□□ 0,76
Rnf5O35445 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Rnf5O35445 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Rnf5O35445 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Rnf5O35445 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,8 ms