Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Pkd2O35245 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Pkd2O35245 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Pkd2O35245 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Pkd2O35245 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Pkd2O35245 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Pkd2O35245 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Pkd2O35245 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Pkd2O35245 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Pkd2O35245 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Pkd2O35245 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Pkd2O35245 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Pkd2O35245 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Pkd2O35245 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Pkd2O35245 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Pkd2O35245 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Pkd2O35245 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Pkd2O35245 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Pkd2O35245 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Pkd2O35245 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Pkd2O35245 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Pkd2O35245 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Pkd2O35245 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Pkd2O35245 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Pkd2O35245 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Pkd2O35245 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Pkd2O35245 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Pkd2O35245 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Pkd2O35245 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Pkd2O35245 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Pkd2O35245 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Pkd2O35245 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Pkd2O35245 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Pkd2O35245 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Pkd2O35245 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Pkd2O35245 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Pkd2O35245 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Pkd2O35245 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Pkd2O35245 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Pkd2O35245 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Pkd2O35245 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Pkd2O35245 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Pkd2O35245 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Pkd2O35245 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Pkd2O35245 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Pkd2O35245 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Pkd2O35245 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Pkd2O35245 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Pkd2O35245 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Pkd2O35245 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Pkd2O35245 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Pkd2O35245 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Pkd2O35245 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Pkd2O35245 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Pkd2O35245 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pkd2O35245 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pkd2O35245 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Pkd2O35245 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pkd2O35245 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Pkd2O35245 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Pkd2O35245 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Pkd2O35245 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Pkd2O35245 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Pkd2O35245 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Pkd2O35245 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pkd2O35245 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pkd2O35245 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pkd2O35245 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Pkd2O35245 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Pkd2O35245 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Pkd2O35245 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Pkd2O35245 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pkd2O35245 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pkd2O35245 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pkd2O35245 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pkd2O35245 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pkd2O35245 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pkd2O35245 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Pkd2O35245 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pkd2O35245 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pkd2O35245 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Pkd2O35245 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Pkd2O35245 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Pkd2O35245 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Pkd2O35245 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pkd2O35245 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pkd2O35245 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pkd2O35245 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pkd2O35245 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pkd2O35245 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pkd2O35245 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pkd2O35245 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Pkd2O35245 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pkd2O35245 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pkd2O35245 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pkd2O35245 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pkd2O35245 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pkd2O35245 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pkd2O35245 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pkd2O35245 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms