Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmd4O35226 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd4O35226 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd4O35226 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd4O35226 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd4O35226 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd4O35226 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd4O35226 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd4O35226 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psmd4O35226 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psmd4O35226 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psmd4O35226 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd4O35226 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd4O35226 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd4O35226 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd4O35226 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd4O35226 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmd4O35226 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmd4O35226 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd4O35226 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psmd4O35226 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Psmd4O35226 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psmd4O35226 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmd4O35226 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psmd4O35226 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmd4O35226 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmd4O35226 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmd4O35226 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmd4O35226 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmd4O35226 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmd4O35226 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmd4O35226 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmd4O35226 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmd4O35226 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmd4O35226 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmd4O35226 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmd4O35226 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd4O35226 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd4O35226 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmd4O35226 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmd4O35226 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd4O35226 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd4O35226 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd4O35226 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd4O35226 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psmd4O35226 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmd4O35226 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmd4O35226 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmd4O35226 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmd4O35226 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd4O35226 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd4O35226 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd4O35226 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd4O35226 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd4O35226 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd4O35226 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd4O35226 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd4O35226 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd4O35226 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd4O35226 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd4O35226 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd4O35226 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd4O35226 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd4O35226 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd4O35226 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd4O35226 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd4O35226 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd4O35226 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd4O35226 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd4O35226 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd4O35226 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmd4O35226 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmd4O35226 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms