Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
ArxO35085 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ArxO35085 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ArxO35085 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ArxO35085 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
ArxO35085 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ArxO35085 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
ArxO35085 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ArxO35085 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ArxO35085 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ArxO35085 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
ArxO35085 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ArxO35085 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ArxO35085 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ArxO35085 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ArxO35085 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ArxO35085 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ArxO35085 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ArxO35085 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ArxO35085 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ArxO35085 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ArxO35085 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ArxO35085 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ArxO35085 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ArxO35085 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ArxO35085 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ArxO35085 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ArxO35085 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ArxO35085 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
ArxO35085 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
ArxO35085 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ArxO35085 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ArxO35085 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ArxO35085 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ArxO35085 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ArxO35085 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ArxO35085 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ArxO35085 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ArxO35085 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ArxO35085 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ArxO35085 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ArxO35085 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ArxO35085 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ArxO35085 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ArxO35085 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ArxO35085 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ArxO35085 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ArxO35085 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ArxO35085 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ArxO35085 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ArxO35085 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ArxO35085 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ArxO35085 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ArxO35085 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ArxO35085 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ArxO35085 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ArxO35085 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ArxO35085 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ArxO35085 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ArxO35085 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ArxO35085 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ArxO35085 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ArxO35085 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ArxO35085 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ArxO35085 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ArxO35085 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ArxO35085 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ArxO35085 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ArxO35085 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ArxO35085 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ArxO35085 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ArxO35085 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
ArxO35085 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ArxO35085 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ArxO35085 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ArxO35085 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ArxO35085 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ArxO35085 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ArxO35085 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ArxO35085 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ArxO35085 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ArxO35085 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ArxO35085 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ArxO35085 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ArxO35085 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ArxO35085 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ArxO35085 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ArxO35085 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ArxO35085 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ArxO35085 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ArxO35085 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ArxO35085 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ArxO35085 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ArxO35085 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ArxO35085 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ArxO35085 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ArxO35085 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ArxO35085 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ArxO35085 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ArxO35085 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms