Protein–RNA interactions for Protein: O09173

Hgd, Homogentisate 1,2-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgdO09173 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HgdO09173 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HgdO09173 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HgdO09173 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HgdO09173 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HgdO09173 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HgdO09173 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HgdO09173 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HgdO09173 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HgdO09173 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HgdO09173 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HgdO09173 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HgdO09173 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HgdO09173 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HgdO09173 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HgdO09173 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HgdO09173 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HgdO09173 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HgdO09173 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HgdO09173 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HgdO09173 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HgdO09173 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HgdO09173 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HgdO09173 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HgdO09173 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HgdO09173 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HgdO09173 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HgdO09173 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HgdO09173 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HgdO09173 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HgdO09173 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HgdO09173 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HgdO09173 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HgdO09173 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HgdO09173 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HgdO09173 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HgdO09173 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HgdO09173 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HgdO09173 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HgdO09173 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HgdO09173 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HgdO09173 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HgdO09173 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HgdO09173 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HgdO09173 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HgdO09173 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HgdO09173 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HgdO09173 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HgdO09173 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HgdO09173 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HgdO09173 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HgdO09173 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HgdO09173 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
HgdO09173 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HgdO09173 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HgdO09173 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HgdO09173 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HgdO09173 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HgdO09173 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HgdO09173 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HgdO09173 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HgdO09173 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HgdO09173 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HgdO09173 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HgdO09173 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HgdO09173 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HgdO09173 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24■■□□□ 1.43
HgdO09173 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HgdO09173 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HgdO09173 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HgdO09173 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HgdO09173 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HgdO09173 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HgdO09173 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HgdO09173 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HgdO09173 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HgdO09173 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HgdO09173 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HgdO09173 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HgdO09173 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HgdO09173 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HgdO09173 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HgdO09173 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HgdO09173 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HgdO09173 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HgdO09173 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HgdO09173 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HgdO09173 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HgdO09173 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HgdO09173 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HgdO09173 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HgdO09173 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HgdO09173 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HgdO09173 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HgdO09173 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HgdO09173 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HgdO09173 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HgdO09173 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HgdO09173 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HgdO09173 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms