Protein–RNA interactions for Protein: O09039

Sh2b3, SH2B adapter protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b3O09039 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh2b3O09039 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh2b3O09039 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh2b3O09039 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2b3O09039 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2b3O09039 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh2b3O09039 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2b3O09039 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh2b3O09039 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh2b3O09039 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh2b3O09039 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh2b3O09039 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh2b3O09039 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh2b3O09039 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh2b3O09039 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh2b3O09039 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh2b3O09039 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh2b3O09039 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh2b3O09039 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh2b3O09039 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh2b3O09039 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh2b3O09039 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b3O09039 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b3O09039 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b3O09039 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b3O09039 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2b3O09039 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2b3O09039 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2b3O09039 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2b3O09039 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2b3O09039 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2b3O09039 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2b3O09039 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh2b3O09039 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2b3O09039 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2b3O09039 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2b3O09039 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh2b3O09039 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh2b3O09039 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh2b3O09039 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b3O09039 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b3O09039 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b3O09039 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b3O09039 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b3O09039 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b3O09039 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b3O09039 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b3O09039 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b3O09039 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b3O09039 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2b3O09039 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2b3O09039 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b3O09039 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b3O09039 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b3O09039 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b3O09039 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b3O09039 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2b3O09039 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b3O09039 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b3O09039 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b3O09039 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b3O09039 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b3O09039 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b3O09039 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh2b3O09039 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh2b3O09039 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 531.3 ms