Protein–RNA interactions for Protein: O08848

Trove2, 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trove2O08848 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Trove2O08848 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trove2O08848 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trove2O08848 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trove2O08848 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trove2O08848 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trove2O08848 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trove2O08848 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trove2O08848 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trove2O08848 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trove2O08848 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trove2O08848 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trove2O08848 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trove2O08848 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trove2O08848 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trove2O08848 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trove2O08848 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trove2O08848 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trove2O08848 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trove2O08848 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Trove2O08848 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trove2O08848 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trove2O08848 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trove2O08848 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trove2O08848 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trove2O08848 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trove2O08848 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trove2O08848 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trove2O08848 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trove2O08848 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trove2O08848 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trove2O08848 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trove2O08848 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trove2O08848 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trove2O08848 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trove2O08848 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trove2O08848 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trove2O08848 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trove2O08848 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trove2O08848 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trove2O08848 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trove2O08848 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trove2O08848 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trove2O08848 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trove2O08848 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trove2O08848 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trove2O08848 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trove2O08848 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trove2O08848 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trove2O08848 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trove2O08848 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trove2O08848 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trove2O08848 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trove2O08848 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trove2O08848 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trove2O08848 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trove2O08848 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trove2O08848 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trove2O08848 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trove2O08848 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trove2O08848 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trove2O08848 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trove2O08848 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trove2O08848 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trove2O08848 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trove2O08848 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trove2O08848 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trove2O08848 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trove2O08848 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trove2O08848 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trove2O08848 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trove2O08848 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trove2O08848 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trove2O08848 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trove2O08848 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trove2O08848 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trove2O08848 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trove2O08848 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trove2O08848 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trove2O08848 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trove2O08848 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trove2O08848 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Trove2O08848 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trove2O08848 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trove2O08848 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms