Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8857L7N291 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8857L7N291 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8857L7N291 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8857L7N291 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm8857L7N291 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8857L7N291 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8857L7N291 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8857L7N291 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8857L7N291 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8857L7N291 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8857L7N291 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8857L7N291 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8857L7N291 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8857L7N291 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8857L7N291 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8857L7N291 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8857L7N291 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8857L7N291 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8857L7N291 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8857L7N291 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8857L7N291 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8857L7N291 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8857L7N291 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8857L7N291 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8857L7N291 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8857L7N291 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8857L7N291 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8857L7N291 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8857L7N291 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8857L7N291 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8857L7N291 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8857L7N291 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8857L7N291 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8857L7N291 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8857L7N291 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8857L7N291 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8857L7N291 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm8857L7N291 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8857L7N291 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8857L7N291 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8857L7N291 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8857L7N291 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8857L7N291 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8857L7N291 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8857L7N291 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8857L7N291 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8857L7N291 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8857L7N291 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8857L7N291 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8857L7N291 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8857L7N291 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8857L7N291 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8857L7N291 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm8857L7N291 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm8857L7N291 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8857L7N291 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8857L7N291 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms