Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IfnabL7MTU6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IfnabL7MTU6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IfnabL7MTU6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IfnabL7MTU6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IfnabL7MTU6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IfnabL7MTU6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IfnabL7MTU6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IfnabL7MTU6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IfnabL7MTU6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IfnabL7MTU6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IfnabL7MTU6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IfnabL7MTU6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IfnabL7MTU6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IfnabL7MTU6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IfnabL7MTU6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IfnabL7MTU6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IfnabL7MTU6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IfnabL7MTU6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IfnabL7MTU6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IfnabL7MTU6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IfnabL7MTU6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IfnabL7MTU6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IfnabL7MTU6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IfnabL7MTU6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IfnabL7MTU6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IfnabL7MTU6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IfnabL7MTU6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IfnabL7MTU6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IfnabL7MTU6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IfnabL7MTU6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IfnabL7MTU6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IfnabL7MTU6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IfnabL7MTU6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IfnabL7MTU6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IfnabL7MTU6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IfnabL7MTU6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IfnabL7MTU6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IfnabL7MTU6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IfnabL7MTU6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IfnabL7MTU6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IfnabL7MTU6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IfnabL7MTU6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IfnabL7MTU6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IfnabL7MTU6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IfnabL7MTU6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IfnabL7MTU6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IfnabL7MTU6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IfnabL7MTU6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IfnabL7MTU6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IfnabL7MTU6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IfnabL7MTU6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IfnabL7MTU6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IfnabL7MTU6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IfnabL7MTU6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IfnabL7MTU6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IfnabL7MTU6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IfnabL7MTU6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IfnabL7MTU6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IfnabL7MTU6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IfnabL7MTU6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IfnabL7MTU6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IfnabL7MTU6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IfnabL7MTU6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IfnabL7MTU6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IfnabL7MTU6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IfnabL7MTU6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IfnabL7MTU6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms