Protein–RNA interactions for Protein: K9J7G9

Gm8677, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8677K9J7G9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8677K9J7G9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8677K9J7G9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8677K9J7G9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8677K9J7G9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8677K9J7G9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8677K9J7G9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8677K9J7G9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8677K9J7G9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8677K9J7G9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8677K9J7G9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8677K9J7G9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8677K9J7G9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8677K9J7G9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8677K9J7G9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8677K9J7G9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8677K9J7G9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8677K9J7G9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8677K9J7G9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8677K9J7G9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8677K9J7G9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8677K9J7G9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8677K9J7G9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8677K9J7G9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8677K9J7G9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8677K9J7G9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8677K9J7G9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8677K9J7G9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8677K9J7G9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8677K9J7G9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8677K9J7G9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8677K9J7G9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm8677K9J7G9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8677K9J7G9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8677K9J7G9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8677K9J7G9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8677K9J7G9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8677K9J7G9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8677K9J7G9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8677K9J7G9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8677K9J7G9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8677K9J7G9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm8677K9J7G9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8677K9J7G9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8677K9J7G9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8677K9J7G9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8677K9J7G9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8677K9J7G9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8677K9J7G9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8677K9J7G9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8677K9J7G9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8677K9J7G9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8677K9J7G9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8677K9J7G9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8677K9J7G9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8677K9J7G9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8677K9J7G9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8677K9J7G9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8677K9J7G9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8677K9J7G9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8677K9J7G9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8677K9J7G9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8677K9J7G9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8677K9J7G9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8677K9J7G9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8677K9J7G9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8677K9J7G9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8677K9J7G9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8677K9J7G9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8677K9J7G9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8677K9J7G9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8677K9J7G9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8677K9J7G9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8677K9J7G9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8677K9J7G9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8677K9J7G9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8677K9J7G9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8677K9J7G9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms