Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc191J3QQ27 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc191J3QQ27 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc191J3QQ27 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc191J3QQ27 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc191J3QQ27 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc191J3QQ27 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc191J3QQ27 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc191J3QQ27 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc191J3QQ27 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc191J3QQ27 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc191J3QQ27 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc191J3QQ27 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc191J3QQ27 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc191J3QQ27 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc191J3QQ27 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc191J3QQ27 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc191J3QQ27 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc191J3QQ27 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc191J3QQ27 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc191J3QQ27 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc191J3QQ27 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc191J3QQ27 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc191J3QQ27 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc191J3QQ27 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc191J3QQ27 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc191J3QQ27 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc191J3QQ27 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc191J3QQ27 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc191J3QQ27 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc191J3QQ27 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc191J3QQ27 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc191J3QQ27 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc191J3QQ27 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc191J3QQ27 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc191J3QQ27 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc191J3QQ27 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc191J3QQ27 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc191J3QQ27 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc191J3QQ27 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc191J3QQ27 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc191J3QQ27 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc191J3QQ27 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc191J3QQ27 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc191J3QQ27 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc191J3QQ27 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc191J3QQ27 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc191J3QQ27 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc191J3QQ27 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc191J3QQ27 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc191J3QQ27 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc191J3QQ27 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc191J3QQ27 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc191J3QQ27 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc191J3QQ27 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc191J3QQ27 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc191J3QQ27 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc191J3QQ27 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc191J3QQ27 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc191J3QQ27 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc191J3QQ27 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc191J3QQ27 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc191J3QQ27 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc191J3QQ27 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc191J3QQ27 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc191J3QQ27 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc191J3QQ27 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc191J3QQ27 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc191J3QQ27 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc191J3QQ27 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc191J3QQ27 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc191J3QQ27 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc191J3QQ27 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc191J3QQ27 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc191J3QQ27 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc191J3QQ27 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc191J3QQ27 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc191J3QQ27 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc191J3QQ27 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc191J3QQ27 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc191J3QQ27 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc191J3QQ27 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc191J3QQ27 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc191J3QQ27 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms