Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm19965J3QNY8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm19965J3QNY8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm19965J3QNY8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm19965J3QNY8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm19965J3QNY8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm19965J3QNY8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm19965J3QNY8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm19965J3QNY8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm19965J3QNY8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm19965J3QNY8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm19965J3QNY8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm19965J3QNY8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm19965J3QNY8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm19965J3QNY8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm19965J3QNY8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm19965J3QNY8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm19965J3QNY8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm19965J3QNY8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm19965J3QNY8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm19965J3QNY8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm19965J3QNY8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm19965J3QNY8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm19965J3QNY8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm19965J3QNY8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm19965J3QNY8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm19965J3QNY8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm19965J3QNY8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm19965J3QNY8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm19965J3QNY8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm19965J3QNY8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm19965J3QNY8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm19965J3QNY8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm19965J3QNY8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm19965J3QNY8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm19965J3QNY8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm19965J3QNY8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm19965J3QNY8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm19965J3QNY8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm19965J3QNY8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm19965J3QNY8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm19965J3QNY8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm19965J3QNY8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm19965J3QNY8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm19965J3QNY8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm19965J3QNY8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm19965J3QNY8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm19965J3QNY8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm19965J3QNY8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm19965J3QNY8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm19965J3QNY8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm19965J3QNY8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm19965J3QNY8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm19965J3QNY8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm19965J3QNY8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm19965J3QNY8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm19965J3QNY8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm19965J3QNY8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm19965J3QNY8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm19965J3QNY8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm19965J3QNY8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm19965J3QNY8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm19965J3QNY8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm19965J3QNY8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm19965J3QNY8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm19965J3QNY8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm19965J3QNY8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm19965J3QNY8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm19965J3QNY8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm19965J3QNY8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm19965J3QNY8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm19965J3QNY8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm19965J3QNY8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm19965J3QNY8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm19965J3QNY8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm19965J3QNY8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm19965J3QNY8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm19965J3QNY8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm19965J3QNY8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms