Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bbip1J3QMK2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbip1J3QMK2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbip1J3QMK2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbip1J3QMK2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bbip1J3QMK2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bbip1J3QMK2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bbip1J3QMK2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbip1J3QMK2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbip1J3QMK2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbip1J3QMK2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbip1J3QMK2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbip1J3QMK2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbip1J3QMK2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bbip1J3QMK2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bbip1J3QMK2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bbip1J3QMK2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbip1J3QMK2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbip1J3QMK2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbip1J3QMK2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbip1J3QMK2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bbip1J3QMK2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbip1J3QMK2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbip1J3QMK2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbip1J3QMK2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbip1J3QMK2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbip1J3QMK2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbip1J3QMK2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bbip1J3QMK2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Bbip1J3QMK2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bbip1J3QMK2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Bbip1J3QMK2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bbip1J3QMK2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bbip1J3QMK2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bbip1J3QMK2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bbip1J3QMK2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bbip1J3QMK2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bbip1J3QMK2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bbip1J3QMK2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bbip1J3QMK2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bbip1J3QMK2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bbip1J3QMK2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bbip1J3QMK2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bbip1J3QMK2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Bbip1J3QMK2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bbip1J3QMK2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bbip1J3QMK2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Bbip1J3QMK2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bbip1J3QMK2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bbip1J3QMK2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bbip1J3QMK2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bbip1J3QMK2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bbip1J3QMK2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bbip1J3QMK2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bbip1J3QMK2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bbip1J3QMK2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbip1J3QMK2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbip1J3QMK2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbip1J3QMK2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bbip1J3QMK2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bbip1J3QMK2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bbip1J3QMK2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bbip1J3QMK2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Bbip1J3QMK2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bbip1J3QMK2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bbip1J3QMK2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bbip1J3QMK2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bbip1J3QMK2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bbip1J3QMK2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bbip1J3QMK2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bbip1J3QMK2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbip1J3QMK2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbip1J3QMK2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbip1J3QMK2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbip1J3QMK2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bbip1J3QMK2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bbip1J3QMK2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbip1J3QMK2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbip1J3QMK2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbip1J3QMK2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bbip1J3QMK2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbip1J3QMK2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbip1J3QMK2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbip1J3QMK2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbip1J3QMK2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbip1J3QMK2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbip1J3QMK2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbip1J3QMK2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bbip1J3QMK2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bbip1J3QMK2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bbip1J3QMK2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bbip1J3QMK2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bbip1J3QMK2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bbip1J3QMK2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bbip1J3QMK2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bbip1J3QMK2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bbip1J3QMK2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bbip1J3QMK2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bbip1J3QMK2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bbip1J3QMK2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms