Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm21897J3KMP5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm21897J3KMP5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm21897J3KMP5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm21897J3KMP5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm21897J3KMP5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm21897J3KMP5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm21897J3KMP5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm21897J3KMP5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm21897J3KMP5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm21897J3KMP5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm21897J3KMP5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm21897J3KMP5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm21897J3KMP5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm21897J3KMP5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm21897J3KMP5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm21897J3KMP5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm21897J3KMP5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm21897J3KMP5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm21897J3KMP5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm21897J3KMP5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm21897J3KMP5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm21897J3KMP5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm21897J3KMP5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm21897J3KMP5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm21897J3KMP5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm21897J3KMP5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm21897J3KMP5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21897J3KMP5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm21897J3KMP5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21897J3KMP5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21897J3KMP5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21897J3KMP5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21897J3KMP5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21897J3KMP5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21897J3KMP5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21897J3KMP5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21897J3KMP5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21897J3KMP5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21897J3KMP5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21897J3KMP5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm21897J3KMP5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm21897J3KMP5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21897J3KMP5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21897J3KMP5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21897J3KMP5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21897J3KMP5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21897J3KMP5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21897J3KMP5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21897J3KMP5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21897J3KMP5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm21897J3KMP5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21897J3KMP5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21897J3KMP5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21897J3KMP5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm21897J3KMP5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21897J3KMP5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21897J3KMP5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21897J3KMP5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21897J3KMP5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21897J3KMP5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm21897J3KMP5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21897J3KMP5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms