Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm20828J3KMI7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm20828J3KMI7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm20828J3KMI7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm20828J3KMI7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm20828J3KMI7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm20828J3KMI7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm20828J3KMI7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm20828J3KMI7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm20828J3KMI7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm20828J3KMI7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm20828J3KMI7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm20828J3KMI7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm20828J3KMI7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm20828J3KMI7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm20828J3KMI7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm20828J3KMI7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm20828J3KMI7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm20828J3KMI7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm20828J3KMI7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm20828J3KMI7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm20828J3KMI7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm20828J3KMI7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm20828J3KMI7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm20828J3KMI7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm20828J3KMI7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm20828J3KMI7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm20828J3KMI7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm20828J3KMI7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm20828J3KMI7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm20828J3KMI7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm20828J3KMI7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm20828J3KMI7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm20828J3KMI7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm20828J3KMI7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm20828J3KMI7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm20828J3KMI7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm20828J3KMI7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm20828J3KMI7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm20828J3KMI7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm20828J3KMI7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm20828J3KMI7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm20828J3KMI7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm20828J3KMI7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm20828J3KMI7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm20828J3KMI7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm20828J3KMI7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm20828J3KMI7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm20828J3KMI7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm20828J3KMI7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm20828J3KMI7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm20828J3KMI7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm20828J3KMI7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm20828J3KMI7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm20828J3KMI7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm20828J3KMI7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm20828J3KMI7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm20828J3KMI7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm20828J3KMI7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm20828J3KMI7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm20828J3KMI7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm20828J3KMI7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm20828J3KMI7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm20828J3KMI7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm20828J3KMI7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm20828J3KMI7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm20828J3KMI7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm20828J3KMI7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm20828J3KMI7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm20828J3KMI7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm20828J3KMI7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm20828J3KMI7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm20828J3KMI7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm20828J3KMI7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm20828J3KMI7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm20828J3KMI7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm20828J3KMI7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm20828J3KMI7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm20828J3KMI7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm20828J3KMI7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm20828J3KMI7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm20828J3KMI7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm20828J3KMI7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm20828J3KMI7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm20828J3KMI7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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