Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Usp17ldG5E8G2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
Usp17ldG5E8G2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Usp17ldG5E8G2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Usp17ldG5E8G2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Usp17ldG5E8G2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Usp17ldG5E8G2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30,19■■■□□ 2,42
Usp17ldG5E8G2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Usp17ldG5E8G2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Usp17ldG5E8G2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Usp17ldG5E8G2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Usp17ldG5E8G2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Usp17ldG5E8G2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30,11■■■□□ 2,41
Usp17ldG5E8G2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Usp17ldG5E8G2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Usp17ldG5E8G2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Usp17ldG5E8G2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Usp17ldG5E8G2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Usp17ldG5E8G2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Usp17ldG5E8G2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Usp17ldG5E8G2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Usp17ldG5E8G2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Usp17ldG5E8G2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Usp17ldG5E8G2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Usp17ldG5E8G2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Usp17ldG5E8G2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Usp17ldG5E8G2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Usp17ldG5E8G2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Usp17ldG5E8G2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Usp17ldG5E8G2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Usp17ldG5E8G2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Usp17ldG5E8G2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Usp17ldG5E8G2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Usp17ldG5E8G2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Usp17ldG5E8G2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Usp17ldG5E8G2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Usp17ldG5E8G2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Usp17ldG5E8G2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Usp17ldG5E8G2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Usp17ldG5E8G2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Usp17ldG5E8G2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Usp17ldG5E8G2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Usp17ldG5E8G2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Usp17ldG5E8G2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Usp17ldG5E8G2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Usp17ldG5E8G2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Usp17ldG5E8G2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Usp17ldG5E8G2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Usp17ldG5E8G2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Usp17ldG5E8G2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Usp17ldG5E8G2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Usp17ldG5E8G2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,36
Usp17ldG5E8G2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Usp17ldG5E8G2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Usp17ldG5E8G2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Usp17ldG5E8G2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Usp17ldG5E8G2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Usp17ldG5E8G2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Usp17ldG5E8G2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Usp17ldG5E8G2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Usp17ldG5E8G2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Usp17ldG5E8G2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Usp17ldG5E8G2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Usp17ldG5E8G2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29,67■■■□□ 2,34
Usp17ldG5E8G2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Usp17ldG5E8G2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Usp17ldG5E8G2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Usp17ldG5E8G2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Usp17ldG5E8G2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Usp17ldG5E8G2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Usp17ldG5E8G2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Usp17ldG5E8G2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Usp17ldG5E8G2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Usp17ldG5E8G2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Usp17ldG5E8G2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Usp17ldG5E8G2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Usp17ldG5E8G2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Usp17ldG5E8G2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Usp17ldG5E8G2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Usp17ldG5E8G2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Usp17ldG5E8G2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Usp17ldG5E8G2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Usp17ldG5E8G2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Usp17ldG5E8G2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Usp17ldG5E8G2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Usp17ldG5E8G2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Usp17ldG5E8G2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Usp17ldG5E8G2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Usp17ldG5E8G2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,49■■■□□ 2,31
Usp17ldG5E8G2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Usp17ldG5E8G2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Usp17ldG5E8G2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Usp17ldG5E8G2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Usp17ldG5E8G2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Usp17ldG5E8G2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Usp17ldG5E8G2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Usp17ldG5E8G2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Usp17ldG5E8G2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Usp17ldG5E8G2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Usp17ldG5E8G2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62,5 ms