Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r58G3X9U3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r58G3X9U3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r58G3X9U3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r58G3X9U3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r58G3X9U3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r58G3X9U3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r58G3X9U3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r58G3X9U3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r58G3X9U3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r58G3X9U3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r58G3X9U3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r58G3X9U3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r58G3X9U3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r58G3X9U3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r58G3X9U3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r58G3X9U3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r58G3X9U3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r58G3X9U3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r58G3X9U3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r58G3X9U3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r58G3X9U3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r58G3X9U3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r58G3X9U3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r58G3X9U3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r58G3X9U3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r58G3X9U3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r58G3X9U3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r58G3X9U3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r58G3X9U3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r58G3X9U3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r58G3X9U3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r58G3X9U3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r58G3X9U3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r58G3X9U3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r58G3X9U3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r58G3X9U3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r58G3X9U3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r58G3X9U3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r58G3X9U3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r58G3X9U3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vmn1r58G3X9U3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vmn1r58G3X9U3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r58G3X9U3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r58G3X9U3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r58G3X9U3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r58G3X9U3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r58G3X9U3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r58G3X9U3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r58G3X9U3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r58G3X9U3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r58G3X9U3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r58G3X9U3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r58G3X9U3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r58G3X9U3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r58G3X9U3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r58G3X9U3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r58G3X9U3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r58G3X9U3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r58G3X9U3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r58G3X9U3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r58G3X9U3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r58G3X9U3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r58G3X9U3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r58G3X9U3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r58G3X9U3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r58G3X9U3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r58G3X9U3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r58G3X9U3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r58G3X9U3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r58G3X9U3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r58G3X9U3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r58G3X9U3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r58G3X9U3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r58G3X9U3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r58G3X9U3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r58G3X9U3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r58G3X9U3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r58G3X9U3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r58G3X9U3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r58G3X9U3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r58G3X9U3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r58G3X9U3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r58G3X9U3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r58G3X9U3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r58G3X9U3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r58G3X9U3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r58G3X9U3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r58G3X9U3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r58G3X9U3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r58G3X9U3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r58G3X9U3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r58G3X9U3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms