Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Pnmal2G3X9N3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pnmal2G3X9N3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pnmal2G3X9N3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pnmal2G3X9N3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pnmal2G3X9N3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pnmal2G3X9N3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Pnmal2G3X9N3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pnmal2G3X9N3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Pnmal2G3X9N3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Pnmal2G3X9N3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pnmal2G3X9N3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pnmal2G3X9N3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pnmal2G3X9N3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pnmal2G3X9N3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pnmal2G3X9N3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pnmal2G3X9N3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pnmal2G3X9N3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Pnmal2G3X9N3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Pnmal2G3X9N3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pnmal2G3X9N3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pnmal2G3X9N3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Pnmal2G3X9N3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Pnmal2G3X9N3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Pnmal2G3X9N3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pnmal2G3X9N3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pnmal2G3X9N3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Pnmal2G3X9N3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Pnmal2G3X9N3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Pnmal2G3X9N3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Pnmal2G3X9N3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Pnmal2G3X9N3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Pnmal2G3X9N3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pnmal2G3X9N3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pnmal2G3X9N3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pnmal2G3X9N3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Pnmal2G3X9N3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Pnmal2G3X9N3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pnmal2G3X9N3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pnmal2G3X9N3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Pnmal2G3X9N3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Pnmal2G3X9N3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Pnmal2G3X9N3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pnmal2G3X9N3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pnmal2G3X9N3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Pnmal2G3X9N3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pnmal2G3X9N3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pnmal2G3X9N3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pnmal2G3X9N3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pnmal2G3X9N3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pnmal2G3X9N3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pnmal2G3X9N3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pnmal2G3X9N3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pnmal2G3X9N3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pnmal2G3X9N3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pnmal2G3X9N3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Pnmal2G3X9N3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pnmal2G3X9N3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pnmal2G3X9N3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pnmal2G3X9N3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pnmal2G3X9N3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pnmal2G3X9N3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pnmal2G3X9N3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pnmal2G3X9N3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Pnmal2G3X9N3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pnmal2G3X9N3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pnmal2G3X9N3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pnmal2G3X9N3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pnmal2G3X9N3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pnmal2G3X9N3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pnmal2G3X9N3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pnmal2G3X9N3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pnmal2G3X9N3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pnmal2G3X9N3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pnmal2G3X9N3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pnmal2G3X9N3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pnmal2G3X9N3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pnmal2G3X9N3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pnmal2G3X9N3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pnmal2G3X9N3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Pnmal2G3X9N3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Pnmal2G3X9N3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Pnmal2G3X9N3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Pnmal2G3X9N3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Pnmal2G3X9N3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms