Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ScaperF8VQ70 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ScaperF8VQ70 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ScaperF8VQ70 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ScaperF8VQ70 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ScaperF8VQ70 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ScaperF8VQ70 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
ScaperF8VQ70 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ScaperF8VQ70 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ScaperF8VQ70 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ScaperF8VQ70 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ScaperF8VQ70 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ScaperF8VQ70 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ScaperF8VQ70 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ScaperF8VQ70 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ScaperF8VQ70 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ScaperF8VQ70 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ScaperF8VQ70 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ScaperF8VQ70 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ScaperF8VQ70 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ScaperF8VQ70 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ScaperF8VQ70 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ScaperF8VQ70 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
ScaperF8VQ70 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
ScaperF8VQ70 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ScaperF8VQ70 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ScaperF8VQ70 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ScaperF8VQ70 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ScaperF8VQ70 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ScaperF8VQ70 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ScaperF8VQ70 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ScaperF8VQ70 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ScaperF8VQ70 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ScaperF8VQ70 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ScaperF8VQ70 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ScaperF8VQ70 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ScaperF8VQ70 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ScaperF8VQ70 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ScaperF8VQ70 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ScaperF8VQ70 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ScaperF8VQ70 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ScaperF8VQ70 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ScaperF8VQ70 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ScaperF8VQ70 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ScaperF8VQ70 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ScaperF8VQ70 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ScaperF8VQ70 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ScaperF8VQ70 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ScaperF8VQ70 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ScaperF8VQ70 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ScaperF8VQ70 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ScaperF8VQ70 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ScaperF8VQ70 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ScaperF8VQ70 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ScaperF8VQ70 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ScaperF8VQ70 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ScaperF8VQ70 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ScaperF8VQ70 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ScaperF8VQ70 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ScaperF8VQ70 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ScaperF8VQ70 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
ScaperF8VQ70 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ScaperF8VQ70 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ScaperF8VQ70 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ScaperF8VQ70 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ScaperF8VQ70 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ScaperF8VQ70 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ScaperF8VQ70 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ScaperF8VQ70 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ScaperF8VQ70 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ScaperF8VQ70 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ScaperF8VQ70 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ScaperF8VQ70 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ScaperF8VQ70 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ScaperF8VQ70 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ScaperF8VQ70 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ScaperF8VQ70 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ScaperF8VQ70 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ScaperF8VQ70 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ScaperF8VQ70 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ScaperF8VQ70 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ScaperF8VQ70 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ScaperF8VQ70 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ScaperF8VQ70 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ScaperF8VQ70 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ScaperF8VQ70 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ScaperF8VQ70 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ScaperF8VQ70 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ScaperF8VQ70 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ScaperF8VQ70 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ScaperF8VQ70 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ScaperF8VQ70 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ScaperF8VQ70 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ScaperF8VQ70 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ScaperF8VQ70 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ScaperF8VQ70 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ScaperF8VQ70 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ScaperF8VQ70 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ScaperF8VQ70 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ScaperF8VQ70 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms