Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm21970F6XX07 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm21970F6XX07 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm21970F6XX07 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21970F6XX07 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21970F6XX07 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21970F6XX07 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21970F6XX07 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm21970F6XX07 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm21970F6XX07 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21970F6XX07 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21970F6XX07 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21970F6XX07 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm21970F6XX07 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm21970F6XX07 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm21970F6XX07 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm21970F6XX07 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm21970F6XX07 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm21970F6XX07 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm21970F6XX07 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm21970F6XX07 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm21970F6XX07 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm21970F6XX07 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm21970F6XX07 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm21970F6XX07 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm21970F6XX07 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm21970F6XX07 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm21970F6XX07 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm21970F6XX07 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm21970F6XX07 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm21970F6XX07 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm21970F6XX07 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm21970F6XX07 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm21970F6XX07 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm21970F6XX07 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm21970F6XX07 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm21970F6XX07 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm21970F6XX07 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm21970F6XX07 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm21970F6XX07 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm21970F6XX07 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm21970F6XX07 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm21970F6XX07 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm21970F6XX07 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm21970F6XX07 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm21970F6XX07 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm21970F6XX07 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm21970F6XX07 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm21970F6XX07 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm21970F6XX07 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm21970F6XX07 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm21970F6XX07 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm21970F6XX07 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm21970F6XX07 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm21970F6XX07 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm21970F6XX07 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm21970F6XX07 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm21970F6XX07 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm21970F6XX07 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm21970F6XX07 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm21970F6XX07 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm21970F6XX07 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm21970F6XX07 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm21970F6XX07 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm21970F6XX07 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm21970F6XX07 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm21970F6XX07 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm21970F6XX07 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm21970F6XX07 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm21970F6XX07 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm21970F6XX07 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm21970F6XX07 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm21970F6XX07 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm21970F6XX07 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm21970F6XX07 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm21970F6XX07 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm21970F6XX07 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm21970F6XX07 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm21970F6XX07 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm21970F6XX07 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm21970F6XX07 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm21970F6XX07 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm21970F6XX07 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm21970F6XX07 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm21970F6XX07 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm21970F6XX07 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm21970F6XX07 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm21970F6XX07 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm21970F6XX07 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm21970F6XX07 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm21970F6XX07 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm21970F6XX07 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21970F6XX07 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21970F6XX07 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21970F6XX07 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21970F6XX07 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21970F6XX07 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm21970F6XX07 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm21970F6XX07 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm21970F6XX07 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms