Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm10477F6SW83 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm10477F6SW83 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm10477F6SW83 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm10477F6SW83 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm10477F6SW83 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm10477F6SW83 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm10477F6SW83 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm10477F6SW83 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm10477F6SW83 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm10477F6SW83 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10477F6SW83 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm10477F6SW83 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10477F6SW83 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm10477F6SW83 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm10477F6SW83 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm10477F6SW83 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm10477F6SW83 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm10477F6SW83 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm10477F6SW83 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10477F6SW83 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10477F6SW83 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10477F6SW83 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10477F6SW83 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm10477F6SW83 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm10477F6SW83 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm10477F6SW83 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10477F6SW83 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10477F6SW83 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10477F6SW83 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10477F6SW83 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10477F6SW83 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10477F6SW83 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm10477F6SW83 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm10477F6SW83 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10477F6SW83 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10477F6SW83 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10477F6SW83 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10477F6SW83 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10477F6SW83 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10477F6SW83 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10477F6SW83 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10477F6SW83 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10477F6SW83 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10477F6SW83 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10477F6SW83 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10477F6SW83 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10477F6SW83 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10477F6SW83 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10477F6SW83 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10477F6SW83 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10477F6SW83 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm10477F6SW83 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10477F6SW83 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10477F6SW83 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10477F6SW83 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm10477F6SW83 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm10477F6SW83 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm10477F6SW83 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10477F6SW83 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10477F6SW83 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10477F6SW83 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10477F6SW83 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm10477F6SW83 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm10477F6SW83 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm10477F6SW83 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm10477F6SW83 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm10477F6SW83 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm10477F6SW83 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm10477F6SW83 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm10477F6SW83 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm10477F6SW83 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10477F6SW83 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10477F6SW83 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10477F6SW83 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10477F6SW83 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10477F6SW83 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10477F6SW83 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm10477F6SW83 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm10477F6SW83 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm10477F6SW83 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm10477F6SW83 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm10477F6SW83 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm10477F6SW83 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm10477F6SW83 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms