Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm340F6RGI3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm340F6RGI3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm340F6RGI3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm340F6RGI3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm340F6RGI3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm340F6RGI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm340F6RGI3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm340F6RGI3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm340F6RGI3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm340F6RGI3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm340F6RGI3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm340F6RGI3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm340F6RGI3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm340F6RGI3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm340F6RGI3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm340F6RGI3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm340F6RGI3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm340F6RGI3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm340F6RGI3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm340F6RGI3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm340F6RGI3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm340F6RGI3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm340F6RGI3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm340F6RGI3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm340F6RGI3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm340F6RGI3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm340F6RGI3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm340F6RGI3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm340F6RGI3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm340F6RGI3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm340F6RGI3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm340F6RGI3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm340F6RGI3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm340F6RGI3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm340F6RGI3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm340F6RGI3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm340F6RGI3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm340F6RGI3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm340F6RGI3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm340F6RGI3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm340F6RGI3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm340F6RGI3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm340F6RGI3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm340F6RGI3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm340F6RGI3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm340F6RGI3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm340F6RGI3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm340F6RGI3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm340F6RGI3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm340F6RGI3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm340F6RGI3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm340F6RGI3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm340F6RGI3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm340F6RGI3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm340F6RGI3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm340F6RGI3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm340F6RGI3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm340F6RGI3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm340F6RGI3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm340F6RGI3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm340F6RGI3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm340F6RGI3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm340F6RGI3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm340F6RGI3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm340F6RGI3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm340F6RGI3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm340F6RGI3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm340F6RGI3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms