Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5407E9Q7Q1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5407E9Q7Q1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5407E9Q7Q1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5407E9Q7Q1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5407E9Q7Q1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5407E9Q7Q1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5407E9Q7Q1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5407E9Q7Q1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5407E9Q7Q1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5407E9Q7Q1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5407E9Q7Q1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5407E9Q7Q1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5407E9Q7Q1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5407E9Q7Q1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5407E9Q7Q1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5407E9Q7Q1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5407E9Q7Q1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5407E9Q7Q1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5407E9Q7Q1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5407E9Q7Q1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5407E9Q7Q1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5407E9Q7Q1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5407E9Q7Q1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5407E9Q7Q1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5407E9Q7Q1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5407E9Q7Q1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5407E9Q7Q1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5407E9Q7Q1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5407E9Q7Q1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5407E9Q7Q1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5407E9Q7Q1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5407E9Q7Q1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5407E9Q7Q1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5407E9Q7Q1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5407E9Q7Q1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5407E9Q7Q1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5407E9Q7Q1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5407E9Q7Q1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5407E9Q7Q1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5407E9Q7Q1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5407E9Q7Q1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5407E9Q7Q1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5407E9Q7Q1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5407E9Q7Q1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5407E9Q7Q1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5407E9Q7Q1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5407E9Q7Q1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5407E9Q7Q1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5407E9Q7Q1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5407E9Q7Q1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5407E9Q7Q1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5407E9Q7Q1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5407E9Q7Q1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5407E9Q7Q1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5407E9Q7Q1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5407E9Q7Q1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5407E9Q7Q1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5407E9Q7Q1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5407E9Q7Q1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5407E9Q7Q1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5407E9Q7Q1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5407E9Q7Q1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5407E9Q7Q1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5407E9Q7Q1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5407E9Q7Q1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5407E9Q7Q1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5407E9Q7Q1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5407E9Q7Q1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5407E9Q7Q1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5407E9Q7Q1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5407E9Q7Q1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5407E9Q7Q1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5407E9Q7Q1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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