Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6J4

Ceacam3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam3E9Q6J4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ceacam3E9Q6J4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ceacam3E9Q6J4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ceacam3E9Q6J4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ceacam3E9Q6J4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ceacam3E9Q6J4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ceacam3E9Q6J4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ceacam3E9Q6J4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ceacam3E9Q6J4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ceacam3E9Q6J4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ceacam3E9Q6J4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ceacam3E9Q6J4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ceacam3E9Q6J4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ceacam3E9Q6J4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ceacam3E9Q6J4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ceacam3E9Q6J4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ceacam3E9Q6J4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ceacam3E9Q6J4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ceacam3E9Q6J4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ceacam3E9Q6J4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ceacam3E9Q6J4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ceacam3E9Q6J4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ceacam3E9Q6J4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ceacam3E9Q6J4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ceacam3E9Q6J4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ceacam3E9Q6J4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ceacam3E9Q6J4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ceacam3E9Q6J4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ceacam3E9Q6J4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ceacam3E9Q6J4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ceacam3E9Q6J4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ceacam3E9Q6J4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ceacam3E9Q6J4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ceacam3E9Q6J4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ceacam3E9Q6J4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ceacam3E9Q6J4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ceacam3E9Q6J4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ceacam3E9Q6J4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ceacam3E9Q6J4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ceacam3E9Q6J4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ceacam3E9Q6J4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ceacam3E9Q6J4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ceacam3E9Q6J4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ceacam3E9Q6J4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ceacam3E9Q6J4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ceacam3E9Q6J4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ceacam3E9Q6J4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ceacam3E9Q6J4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ceacam3E9Q6J4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ceacam3E9Q6J4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ceacam3E9Q6J4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ceacam3E9Q6J4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ceacam3E9Q6J4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ceacam3E9Q6J4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ceacam3E9Q6J4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ceacam3E9Q6J4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ceacam3E9Q6J4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ceacam3E9Q6J4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ceacam3E9Q6J4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ceacam3E9Q6J4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ceacam3E9Q6J4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ceacam3E9Q6J4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ceacam3E9Q6J4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ceacam3E9Q6J4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms