Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3T6

Prdm14, PR domain zinc finger protein 14, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm14E9Q3T6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm14E9Q3T6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm14E9Q3T6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm14E9Q3T6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm14E9Q3T6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm14E9Q3T6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm14E9Q3T6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm14E9Q3T6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm14E9Q3T6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm14E9Q3T6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm14E9Q3T6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm14E9Q3T6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm14E9Q3T6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm14E9Q3T6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm14E9Q3T6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm14E9Q3T6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm14E9Q3T6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm14E9Q3T6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm14E9Q3T6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm14E9Q3T6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm14E9Q3T6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prdm14E9Q3T6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm14E9Q3T6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm14E9Q3T6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm14E9Q3T6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm14E9Q3T6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm14E9Q3T6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm14E9Q3T6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm14E9Q3T6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm14E9Q3T6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm14E9Q3T6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm14E9Q3T6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm14E9Q3T6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm14E9Q3T6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm14E9Q3T6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm14E9Q3T6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm14E9Q3T6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm14E9Q3T6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm14E9Q3T6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm14E9Q3T6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm14E9Q3T6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm14E9Q3T6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm14E9Q3T6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm14E9Q3T6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm14E9Q3T6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm14E9Q3T6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm14E9Q3T6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm14E9Q3T6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm14E9Q3T6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm14E9Q3T6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm14E9Q3T6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm14E9Q3T6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm14E9Q3T6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm14E9Q3T6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm14E9Q3T6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm14E9Q3T6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm14E9Q3T6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm14E9Q3T6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm14E9Q3T6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm14E9Q3T6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm14E9Q3T6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm14E9Q3T6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm14E9Q3T6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm14E9Q3T6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm14E9Q3T6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm14E9Q3T6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm14E9Q3T6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm14E9Q3T6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm14E9Q3T6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm14E9Q3T6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm14E9Q3T6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm14E9Q3T6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm14E9Q3T6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm14E9Q3T6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm14E9Q3T6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm14E9Q3T6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm14E9Q3T6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm14E9Q3T6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm14E9Q3T6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm14E9Q3T6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm14E9Q3T6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm14E9Q3T6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm14E9Q3T6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm14E9Q3T6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm14E9Q3T6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms