Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ddx60E9PZQ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ddx60E9PZQ1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ddx60E9PZQ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ddx60E9PZQ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Ddx60E9PZQ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ddx60E9PZQ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ddx60E9PZQ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ddx60E9PZQ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Ddx60E9PZQ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ddx60E9PZQ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ddx60E9PZQ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ddx60E9PZQ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ddx60E9PZQ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ddx60E9PZQ1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ddx60E9PZQ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ddx60E9PZQ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ddx60E9PZQ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ddx60E9PZQ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ddx60E9PZQ1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ddx60E9PZQ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ddx60E9PZQ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ddx60E9PZQ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ddx60E9PZQ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ddx60E9PZQ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Ddx60E9PZQ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ddx60E9PZQ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ddx60E9PZQ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ddx60E9PZQ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ddx60E9PZQ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ddx60E9PZQ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ddx60E9PZQ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ddx60E9PZQ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ddx60E9PZQ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ddx60E9PZQ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ddx60E9PZQ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ddx60E9PZQ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ddx60E9PZQ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ddx60E9PZQ1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ddx60E9PZQ1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ddx60E9PZQ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ddx60E9PZQ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ddx60E9PZQ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ddx60E9PZQ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ddx60E9PZQ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ddx60E9PZQ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Ddx60E9PZQ1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ddx60E9PZQ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ddx60E9PZQ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ddx60E9PZQ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ddx60E9PZQ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ddx60E9PZQ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ddx60E9PZQ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ddx60E9PZQ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ddx60E9PZQ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ddx60E9PZQ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ddx60E9PZQ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ddx60E9PZQ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Ddx60E9PZQ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Ddx60E9PZQ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Ddx60E9PZQ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ddx60E9PZQ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ddx60E9PZQ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ddx60E9PZQ1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Ddx60E9PZQ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ddx60E9PZQ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ddx60E9PZQ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ddx60E9PZQ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ddx60E9PZQ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ddx60E9PZQ1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ddx60E9PZQ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ddx60E9PZQ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Ddx60E9PZQ1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ddx60E9PZQ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ddx60E9PZQ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ddx60E9PZQ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ddx60E9PZQ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Ddx60E9PZQ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ddx60E9PZQ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ddx60E9PZQ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ddx60E9PZQ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ddx60E9PZQ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ddx60E9PZQ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ddx60E9PZQ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ddx60E9PZQ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ddx60E9PZQ1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Ddx60E9PZQ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ddx60E9PZQ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ddx60E9PZQ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
Ddx60E9PZQ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ddx60E9PZQ1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Ddx60E9PZQ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ddx60E9PZQ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ddx60E9PZQ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ddx60E9PZQ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Ddx60E9PZQ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ddx60E9PZQ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ddx60E9PZQ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ddx60E9PZQ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
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