Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm9008E9PVG0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm9008E9PVG0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm9008E9PVG0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm9008E9PVG0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm9008E9PVG0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm9008E9PVG0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm9008E9PVG0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm9008E9PVG0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm9008E9PVG0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm9008E9PVG0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm9008E9PVG0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm9008E9PVG0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm9008E9PVG0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm9008E9PVG0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm9008E9PVG0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm9008E9PVG0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm9008E9PVG0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm9008E9PVG0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm9008E9PVG0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm9008E9PVG0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm9008E9PVG0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm9008E9PVG0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm9008E9PVG0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm9008E9PVG0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm9008E9PVG0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm9008E9PVG0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm9008E9PVG0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm9008E9PVG0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm9008E9PVG0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm9008E9PVG0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm9008E9PVG0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm9008E9PVG0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm9008E9PVG0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm9008E9PVG0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm9008E9PVG0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm9008E9PVG0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm9008E9PVG0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm9008E9PVG0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm9008E9PVG0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm9008E9PVG0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm9008E9PVG0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm9008E9PVG0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm9008E9PVG0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm9008E9PVG0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm9008E9PVG0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm9008E9PVG0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm9008E9PVG0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm9008E9PVG0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm9008E9PVG0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm9008E9PVG0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm9008E9PVG0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm9008E9PVG0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm9008E9PVG0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm9008E9PVG0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm9008E9PVG0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm9008E9PVG0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm9008E9PVG0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm9008E9PVG0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm9008E9PVG0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm9008E9PVG0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm9008E9PVG0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm9008E9PVG0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm9008E9PVG0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms