Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc175E9PVB3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc175E9PVB3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc175E9PVB3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc175E9PVB3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc175E9PVB3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc175E9PVB3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc175E9PVB3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc175E9PVB3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc175E9PVB3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc175E9PVB3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc175E9PVB3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc175E9PVB3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc175E9PVB3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc175E9PVB3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc175E9PVB3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc175E9PVB3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc175E9PVB3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc175E9PVB3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc175E9PVB3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc175E9PVB3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc175E9PVB3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc175E9PVB3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc175E9PVB3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc175E9PVB3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc175E9PVB3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc175E9PVB3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc175E9PVB3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc175E9PVB3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc175E9PVB3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc175E9PVB3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc175E9PVB3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc175E9PVB3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc175E9PVB3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc175E9PVB3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc175E9PVB3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc175E9PVB3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc175E9PVB3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc175E9PVB3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc175E9PVB3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc175E9PVB3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc175E9PVB3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc175E9PVB3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc175E9PVB3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc175E9PVB3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc175E9PVB3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc175E9PVB3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc175E9PVB3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc175E9PVB3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc175E9PVB3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc175E9PVB3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc175E9PVB3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc175E9PVB3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc175E9PVB3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc175E9PVB3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc175E9PVB3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc175E9PVB3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc175E9PVB3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc175E9PVB3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc175E9PVB3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc175E9PVB3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc175E9PVB3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc175E9PVB3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc175E9PVB3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc175E9PVB3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc175E9PVB3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc175E9PVB3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc175E9PVB3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc175E9PVB3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc175E9PVB3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc175E9PVB3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc175E9PVB3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc175E9PVB3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc175E9PVB3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc175E9PVB3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc175E9PVB3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc175E9PVB3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc175E9PVB3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc175E9PVB3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc175E9PVB3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc175E9PVB3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc175E9PVB3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms