Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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