Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2X2

Dnhd1, Dynein heavy chain domain 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnhd1D3Z2X2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnhd1D3Z2X2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnhd1D3Z2X2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnhd1D3Z2X2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnhd1D3Z2X2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnhd1D3Z2X2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnhd1D3Z2X2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnhd1D3Z2X2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnhd1D3Z2X2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnhd1D3Z2X2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnhd1D3Z2X2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnhd1D3Z2X2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnhd1D3Z2X2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnhd1D3Z2X2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnhd1D3Z2X2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnhd1D3Z2X2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnhd1D3Z2X2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnhd1D3Z2X2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnhd1D3Z2X2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnhd1D3Z2X2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnhd1D3Z2X2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnhd1D3Z2X2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnhd1D3Z2X2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnhd1D3Z2X2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnhd1D3Z2X2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnhd1D3Z2X2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnhd1D3Z2X2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnhd1D3Z2X2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnhd1D3Z2X2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnhd1D3Z2X2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnhd1D3Z2X2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnhd1D3Z2X2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnhd1D3Z2X2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnhd1D3Z2X2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnhd1D3Z2X2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnhd1D3Z2X2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnhd1D3Z2X2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnhd1D3Z2X2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnhd1D3Z2X2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnhd1D3Z2X2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnhd1D3Z2X2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnhd1D3Z2X2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnhd1D3Z2X2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnhd1D3Z2X2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnhd1D3Z2X2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnhd1D3Z2X2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnhd1D3Z2X2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnhd1D3Z2X2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnhd1D3Z2X2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnhd1D3Z2X2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnhd1D3Z2X2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnhd1D3Z2X2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnhd1D3Z2X2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms