Protein–RNA interactions for Protein: D3Z291

Calhm1, Calcium homeostasis modulator protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm1D3Z291 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calhm1D3Z291 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calhm1D3Z291 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calhm1D3Z291 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calhm1D3Z291 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calhm1D3Z291 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Calhm1D3Z291 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calhm1D3Z291 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calhm1D3Z291 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calhm1D3Z291 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calhm1D3Z291 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calhm1D3Z291 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calhm1D3Z291 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calhm1D3Z291 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calhm1D3Z291 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calhm1D3Z291 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calhm1D3Z291 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calhm1D3Z291 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calhm1D3Z291 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Calhm1D3Z291 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calhm1D3Z291 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calhm1D3Z291 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calhm1D3Z291 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Calhm1D3Z291 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calhm1D3Z291 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calhm1D3Z291 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calhm1D3Z291 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calhm1D3Z291 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calhm1D3Z291 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calhm1D3Z291 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calhm1D3Z291 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calhm1D3Z291 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calhm1D3Z291 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calhm1D3Z291 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calhm1D3Z291 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calhm1D3Z291 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calhm1D3Z291 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calhm1D3Z291 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Calhm1D3Z291 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calhm1D3Z291 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calhm1D3Z291 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calhm1D3Z291 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calhm1D3Z291 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calhm1D3Z291 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calhm1D3Z291 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Calhm1D3Z291 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calhm1D3Z291 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calhm1D3Z291 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calhm1D3Z291 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calhm1D3Z291 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calhm1D3Z291 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Calhm1D3Z291 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calhm1D3Z291 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calhm1D3Z291 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calhm1D3Z291 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calhm1D3Z291 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calhm1D3Z291 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calhm1D3Z291 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calhm1D3Z291 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calhm1D3Z291 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calhm1D3Z291 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calhm1D3Z291 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calhm1D3Z291 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calhm1D3Z291 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calhm1D3Z291 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calhm1D3Z291 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Calhm1D3Z291 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.9 ms