Protein–RNA interactions for Protein: D3YX29

Omt2b, Oocyte maturation, beta, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Omt2bD3YX29 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Omt2bD3YX29 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Omt2bD3YX29 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Omt2bD3YX29 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Omt2bD3YX29 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Omt2bD3YX29 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Omt2bD3YX29 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Omt2bD3YX29 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Omt2bD3YX29 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Omt2bD3YX29 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Omt2bD3YX29 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Omt2bD3YX29 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Omt2bD3YX29 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Omt2bD3YX29 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Omt2bD3YX29 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Omt2bD3YX29 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Omt2bD3YX29 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Omt2bD3YX29 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Omt2bD3YX29 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Omt2bD3YX29 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Omt2bD3YX29 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Omt2bD3YX29 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Omt2bD3YX29 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Omt2bD3YX29 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Omt2bD3YX29 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Omt2bD3YX29 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Omt2bD3YX29 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Omt2bD3YX29 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Omt2bD3YX29 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Omt2bD3YX29 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Omt2bD3YX29 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Omt2bD3YX29 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Omt2bD3YX29 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Omt2bD3YX29 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Omt2bD3YX29 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Omt2bD3YX29 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Omt2bD3YX29 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Omt2bD3YX29 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Omt2bD3YX29 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Omt2bD3YX29 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Omt2bD3YX29 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Omt2bD3YX29 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Omt2bD3YX29 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Omt2bD3YX29 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Omt2bD3YX29 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Omt2bD3YX29 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Omt2bD3YX29 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Omt2bD3YX29 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Omt2bD3YX29 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Omt2bD3YX29 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Omt2bD3YX29 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Omt2bD3YX29 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Omt2bD3YX29 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Omt2bD3YX29 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Omt2bD3YX29 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Omt2bD3YX29 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Omt2bD3YX29 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Omt2bD3YX29 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Omt2bD3YX29 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Omt2bD3YX29 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms