Protein–RNA interactions for Protein: D3YUU6

Crnn, Cornulin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrnnD3YUU6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CrnnD3YUU6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CrnnD3YUU6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrnnD3YUU6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrnnD3YUU6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrnnD3YUU6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrnnD3YUU6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CrnnD3YUU6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrnnD3YUU6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrnnD3YUU6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrnnD3YUU6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrnnD3YUU6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrnnD3YUU6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrnnD3YUU6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrnnD3YUU6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrnnD3YUU6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrnnD3YUU6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CrnnD3YUU6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CrnnD3YUU6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CrnnD3YUU6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CrnnD3YUU6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CrnnD3YUU6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CrnnD3YUU6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CrnnD3YUU6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrnnD3YUU6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrnnD3YUU6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrnnD3YUU6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CrnnD3YUU6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CrnnD3YUU6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CrnnD3YUU6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CrnnD3YUU6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CrnnD3YUU6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CrnnD3YUU6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CrnnD3YUU6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrnnD3YUU6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrnnD3YUU6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CrnnD3YUU6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrnnD3YUU6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CrnnD3YUU6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrnnD3YUU6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrnnD3YUU6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrnnD3YUU6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrnnD3YUU6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrnnD3YUU6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrnnD3YUU6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrnnD3YUU6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrnnD3YUU6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrnnD3YUU6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrnnD3YUU6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrnnD3YUU6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrnnD3YUU6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CrnnD3YUU6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CrnnD3YUU6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CrnnD3YUU6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrnnD3YUU6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CrnnD3YUU6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrnnD3YUU6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrnnD3YUU6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrnnD3YUU6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrnnD3YUU6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrnnD3YUU6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrnnD3YUU6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrnnD3YUU6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrnnD3YUU6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrnnD3YUU6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CrnnD3YUU6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrnnD3YUU6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrnnD3YUU6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrnnD3YUU6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrnnD3YUU6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrnnD3YUU6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrnnD3YUU6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrnnD3YUU6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrnnD3YUU6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrnnD3YUU6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrnnD3YUU6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrnnD3YUU6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrnnD3YUU6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrnnD3YUU6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CrnnD3YUU6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrnnD3YUU6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrnnD3YUU6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrnnD3YUU6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrnnD3YUU6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrnnD3YUU6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 593.4 ms