Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mterf1bB9EJ57 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mterf1bB9EJ57 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mterf1bB9EJ57 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mterf1bB9EJ57 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Mterf1bB9EJ57 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mterf1bB9EJ57 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mterf1bB9EJ57 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mterf1bB9EJ57 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mterf1bB9EJ57 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mterf1bB9EJ57 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mterf1bB9EJ57 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mterf1bB9EJ57 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mterf1bB9EJ57 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mterf1bB9EJ57 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mterf1bB9EJ57 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mterf1bB9EJ57 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mterf1bB9EJ57 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mterf1bB9EJ57 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mterf1bB9EJ57 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mterf1bB9EJ57 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mterf1bB9EJ57 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mterf1bB9EJ57 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mterf1bB9EJ57 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mterf1bB9EJ57 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mterf1bB9EJ57 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mterf1bB9EJ57 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mterf1bB9EJ57 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mterf1bB9EJ57 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mterf1bB9EJ57 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mterf1bB9EJ57 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mterf1bB9EJ57 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mterf1bB9EJ57 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mterf1bB9EJ57 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mterf1bB9EJ57 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mterf1bB9EJ57 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mterf1bB9EJ57 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mterf1bB9EJ57 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mterf1bB9EJ57 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mterf1bB9EJ57 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mterf1bB9EJ57 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mterf1bB9EJ57 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mterf1bB9EJ57 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mterf1bB9EJ57 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mterf1bB9EJ57 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mterf1bB9EJ57 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mterf1bB9EJ57 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mterf1bB9EJ57 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mterf1bB9EJ57 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mterf1bB9EJ57 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mterf1bB9EJ57 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mterf1bB9EJ57 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mterf1bB9EJ57 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mterf1bB9EJ57 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mterf1bB9EJ57 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mterf1bB9EJ57 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mterf1bB9EJ57 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mterf1bB9EJ57 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mterf1bB9EJ57 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mterf1bB9EJ57 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mterf1bB9EJ57 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mterf1bB9EJ57 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mterf1bB9EJ57 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mterf1bB9EJ57 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mterf1bB9EJ57 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mterf1bB9EJ57 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mterf1bB9EJ57 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mterf1bB9EJ57 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms