Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Itga9B8JK39 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Itga9B8JK39 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Itga9B8JK39 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Itga9B8JK39 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Itga9B8JK39 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Itga9B8JK39 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Itga9B8JK39 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Itga9B8JK39 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Itga9B8JK39 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Itga9B8JK39 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Itga9B8JK39 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Itga9B8JK39 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Itga9B8JK39 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Itga9B8JK39 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Itga9B8JK39 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Itga9B8JK39 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Itga9B8JK39 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Itga9B8JK39 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Itga9B8JK39 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Itga9B8JK39 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Itga9B8JK39 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Itga9B8JK39 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Itga9B8JK39 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Itga9B8JK39 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Itga9B8JK39 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Itga9B8JK39 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Itga9B8JK39 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Itga9B8JK39 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Itga9B8JK39 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Itga9B8JK39 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Itga9B8JK39 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Itga9B8JK39 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Itga9B8JK39 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Itga9B8JK39 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Itga9B8JK39 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Itga9B8JK39 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Itga9B8JK39 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Itga9B8JK39 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Itga9B8JK39 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Itga9B8JK39 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Itga9B8JK39 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Itga9B8JK39 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Itga9B8JK39 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Itga9B8JK39 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Itga9B8JK39 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Itga9B8JK39 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Itga9B8JK39 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Itga9B8JK39 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Itga9B8JK39 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Itga9B8JK39 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Itga9B8JK39 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Itga9B8JK39 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Itga9B8JK39 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Itga9B8JK39 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Itga9B8JK39 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Itga9B8JK39 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Itga9B8JK39 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Itga9B8JK39 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Itga9B8JK39 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Itga9B8JK39 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Itga9B8JK39 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Itga9B8JK39 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Itga9B8JK39 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Itga9B8JK39 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Itga9B8JK39 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Itga9B8JK39 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Itga9B8JK39 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Itga9B8JK39 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Itga9B8JK39 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Itga9B8JK39 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Itga9B8JK39 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Itga9B8JK39 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Itga9B8JK39 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Itga9B8JK39 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Itga9B8JK39 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Itga9B8JK39 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Itga9B8JK39 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Itga9B8JK39 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Itga9B8JK39 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Itga9B8JK39 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Itga9B8JK39 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Itga9B8JK39 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Itga9B8JK39 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,4 ms