Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
PtprbB2RU80 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
PtprbB2RU80 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
PtprbB2RU80 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
PtprbB2RU80 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
PtprbB2RU80 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
PtprbB2RU80 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23,34■■□□□ 1,33
PtprbB2RU80 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,33
PtprbB2RU80 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,32
PtprbB2RU80 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
PtprbB2RU80 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23,32■■□□□ 1,32
PtprbB2RU80 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
PtprbB2RU80 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
PtprbB2RU80 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,32
PtprbB2RU80 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
PtprbB2RU80 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
PtprbB2RU80 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23,24■■□□□ 1,31
PtprbB2RU80 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,24■■□□□ 1,31
PtprbB2RU80 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
PtprbB2RU80 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,18■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23,18■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23,18■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23,16■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23,15■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
PtprbB2RU80 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23,12■■□□□ 1,29
PtprbB2RU80 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23,12■■□□□ 1,29
PtprbB2RU80 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
PtprbB2RU80 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
PtprbB2RU80 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
PtprbB2RU80 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
PtprbB2RU80 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,09■■□□□ 1,29
PtprbB2RU80 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
PtprbB2RU80 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
PtprbB2RU80 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
PtprbB2RU80 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,08■■□□□ 1,29
PtprbB2RU80 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23,08■■□□□ 1,29
PtprbB2RU80 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,08■■□□□ 1,28
PtprbB2RU80 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
PtprbB2RU80 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
PtprbB2RU80 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
PtprbB2RU80 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
PtprbB2RU80 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23,03■■□□□ 1,28
PtprbB2RU80 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
PtprbB2RU80 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
PtprbB2RU80 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
PtprbB2RU80 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
PtprbB2RU80 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
PtprbB2RU80 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23,01■■□□□ 1,27
PtprbB2RU80 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
PtprbB2RU80 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
PtprbB2RU80 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
PtprbB2RU80 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
PtprbB2RU80 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
PtprbB2RU80 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
PtprbB2RU80 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22,95■■□□□ 1,26
PtprbB2RU80 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
PtprbB2RU80 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22,94■■□□□ 1,26
PtprbB2RU80 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22,94■■□□□ 1,26
PtprbB2RU80 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
PtprbB2RU80 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
PtprbB2RU80 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
PtprbB2RU80 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
PtprbB2RU80 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
PtprbB2RU80 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
PtprbB2RU80 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
PtprbB2RU80 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
PtprbB2RU80 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
PtprbB2RU80 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
PtprbB2RU80 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,88■■□□□ 1,25
PtprbB2RU80 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
PtprbB2RU80 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,87■■□□□ 1,25
PtprbB2RU80 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22,87■■□□□ 1,25
PtprbB2RU80 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
PtprbB2RU80 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
PtprbB2RU80 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
PtprbB2RU80 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
PtprbB2RU80 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,25
PtprbB2RU80 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,83■■□□□ 1,24
PtprbB2RU80 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,83■■□□□ 1,24
PtprbB2RU80 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
PtprbB2RU80 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
PtprbB2RU80 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
PtprbB2RU80 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
PtprbB2RU80 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22,8■■□□□ 1,24
PtprbB2RU80 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
PtprbB2RU80 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,79■■□□□ 1,24
PtprbB2RU80 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
PtprbB2RU80 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
PtprbB2RU80 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,5 ms