Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Cpb1B2RS76 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Cpb1B2RS76 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Cpb1B2RS76 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Cpb1B2RS76 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Cpb1B2RS76 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Cpb1B2RS76 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Cpb1B2RS76 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
Cpb1B2RS76 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Cpb1B2RS76 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Cpb1B2RS76 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Cpb1B2RS76 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Cpb1B2RS76 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Cpb1B2RS76 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Cpb1B2RS76 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Cpb1B2RS76 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Cpb1B2RS76 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Cpb1B2RS76 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Cpb1B2RS76 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Cpb1B2RS76 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Cpb1B2RS76 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Cpb1B2RS76 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Cpb1B2RS76 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Cpb1B2RS76 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Cpb1B2RS76 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cpb1B2RS76 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cpb1B2RS76 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Cpb1B2RS76 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cpb1B2RS76 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Cpb1B2RS76 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28,51■■■□□ 2,16
Cpb1B2RS76 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Cpb1B2RS76 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Cpb1B2RS76 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Cpb1B2RS76 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Cpb1B2RS76 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Cpb1B2RS76 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Cpb1B2RS76 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Cpb1B2RS76 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Cpb1B2RS76 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Cpb1B2RS76 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Cpb1B2RS76 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Cpb1B2RS76 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Cpb1B2RS76 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Cpb1B2RS76 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Cpb1B2RS76 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Cpb1B2RS76 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cpb1B2RS76 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Cpb1B2RS76 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Cpb1B2RS76 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Cpb1B2RS76 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Cpb1B2RS76 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Cpb1B2RS76 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Cpb1B2RS76 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Cpb1B2RS76 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Cpb1B2RS76 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Cpb1B2RS76 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Cpb1B2RS76 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Cpb1B2RS76 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Cpb1B2RS76 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,31■■■□□ 2,12
Cpb1B2RS76 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Cpb1B2RS76 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Cpb1B2RS76 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Cpb1B2RS76 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Cpb1B2RS76 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Cpb1B2RS76 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Cpb1B2RS76 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Cpb1B2RS76 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Cpb1B2RS76 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Cpb1B2RS76 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Cpb1B2RS76 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Cpb1B2RS76 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Cpb1B2RS76 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Cpb1B2RS76 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Cpb1B2RS76 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Cpb1B2RS76 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Cpb1B2RS76 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Cpb1B2RS76 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Cpb1B2RS76 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Cpb1B2RS76 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Cpb1B2RS76 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Cpb1B2RS76 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Cpb1B2RS76 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Cpb1B2RS76 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Cpb1B2RS76 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cpb1B2RS76 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Cpb1B2RS76 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Cpb1B2RS76 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cpb1B2RS76 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cpb1B2RS76 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Cpb1B2RS76 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Cpb1B2RS76 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cpb1B2RS76 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,08
Cpb1B2RS76 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,08
Cpb1B2RS76 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cpb1B2RS76 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cpb1B2RS76 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cpb1B2RS76 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cpb1B2RS76 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cpb1B2RS76 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Cpb1B2RS76 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,6 ms