Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trabd2bB1ATG9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trabd2bB1ATG9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trabd2bB1ATG9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trabd2bB1ATG9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trabd2bB1ATG9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trabd2bB1ATG9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trabd2bB1ATG9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trabd2bB1ATG9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trabd2bB1ATG9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trabd2bB1ATG9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trabd2bB1ATG9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trabd2bB1ATG9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trabd2bB1ATG9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trabd2bB1ATG9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trabd2bB1ATG9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trabd2bB1ATG9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trabd2bB1ATG9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trabd2bB1ATG9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trabd2bB1ATG9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trabd2bB1ATG9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trabd2bB1ATG9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trabd2bB1ATG9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trabd2bB1ATG9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trabd2bB1ATG9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trabd2bB1ATG9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trabd2bB1ATG9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trabd2bB1ATG9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trabd2bB1ATG9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trabd2bB1ATG9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trabd2bB1ATG9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trabd2bB1ATG9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trabd2bB1ATG9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trabd2bB1ATG9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trabd2bB1ATG9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trabd2bB1ATG9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trabd2bB1ATG9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trabd2bB1ATG9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trabd2bB1ATG9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Trabd2bB1ATG9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trabd2bB1ATG9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trabd2bB1ATG9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trabd2bB1ATG9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trabd2bB1ATG9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trabd2bB1ATG9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trabd2bB1ATG9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trabd2bB1ATG9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trabd2bB1ATG9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trabd2bB1ATG9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trabd2bB1ATG9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trabd2bB1ATG9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trabd2bB1ATG9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trabd2bB1ATG9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trabd2bB1ATG9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trabd2bB1ATG9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trabd2bB1ATG9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trabd2bB1ATG9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trabd2bB1ATG9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trabd2bB1ATG9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trabd2bB1ATG9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trabd2bB1ATG9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trabd2bB1ATG9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trabd2bB1ATG9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trabd2bB1ATG9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trabd2bB1ATG9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trabd2bB1ATG9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trabd2bB1ATG9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trabd2bB1ATG9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trabd2bB1ATG9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trabd2bB1ATG9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trabd2bB1ATG9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trabd2bB1ATG9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trabd2bB1ATG9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trabd2bB1ATG9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trabd2bB1ATG9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trabd2bB1ATG9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trabd2bB1ATG9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trabd2bB1ATG9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trabd2bB1ATG9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trabd2bB1ATG9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trabd2bB1ATG9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trabd2bB1ATG9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trabd2bB1ATG9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trabd2bB1ATG9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trabd2bB1ATG9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trabd2bB1ATG9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trabd2bB1ATG9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trabd2bB1ATG9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trabd2bB1ATG9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trabd2bB1ATG9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trabd2bB1ATG9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trabd2bB1ATG9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trabd2bB1ATG9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trabd2bB1ATG9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trabd2bB1ATG9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trabd2bB1ATG9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trabd2bB1ATG9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trabd2bB1ATG9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trabd2bB1ATG9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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