Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slfn8B1ARD8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slfn8B1ARD8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slfn8B1ARD8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slfn8B1ARD8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slfn8B1ARD8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slfn8B1ARD8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slfn8B1ARD8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Slfn8B1ARD8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slfn8B1ARD8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slfn8B1ARD8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slfn8B1ARD8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slfn8B1ARD8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slfn8B1ARD8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slfn8B1ARD8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slfn8B1ARD8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slfn8B1ARD8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slfn8B1ARD8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slfn8B1ARD8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slfn8B1ARD8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slfn8B1ARD8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slfn8B1ARD8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slfn8B1ARD8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slfn8B1ARD8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slfn8B1ARD8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slfn8B1ARD8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slfn8B1ARD8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slfn8B1ARD8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slfn8B1ARD8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slfn8B1ARD8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slfn8B1ARD8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slfn8B1ARD8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slfn8B1ARD8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slfn8B1ARD8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slfn8B1ARD8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slfn8B1ARD8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slfn8B1ARD8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slfn8B1ARD8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slfn8B1ARD8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slfn8B1ARD8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slfn8B1ARD8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slfn8B1ARD8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slfn8B1ARD8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slfn8B1ARD8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slfn8B1ARD8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slfn8B1ARD8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slfn8B1ARD8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slfn8B1ARD8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slfn8B1ARD8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slfn8B1ARD8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Slfn8B1ARD8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slfn8B1ARD8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slfn8B1ARD8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slfn8B1ARD8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slfn8B1ARD8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slfn8B1ARD8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slfn8B1ARD8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slfn8B1ARD8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slfn8B1ARD8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slfn8B1ARD8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slfn8B1ARD8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Slfn8B1ARD8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slfn8B1ARD8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slfn8B1ARD8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slfn8B1ARD8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slfn8B1ARD8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slfn8B1ARD8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slfn8B1ARD8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slfn8B1ARD8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slfn8B1ARD8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slfn8B1ARD8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slfn8B1ARD8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slfn8B1ARD8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slfn8B1ARD8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slfn8B1ARD8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slfn8B1ARD8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slfn8B1ARD8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slfn8B1ARD8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slfn8B1ARD8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slfn8B1ARD8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Slfn8B1ARD8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slfn8B1ARD8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slfn8B1ARD8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slfn8B1ARD8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms