Protein–RNA interactions for Protein: A7M7C7

Skor2, SKI family transcriptional corepressor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,008 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor2A7M7C7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Skor2A7M7C7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Skor2A7M7C7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Skor2A7M7C7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Skor2A7M7C7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Skor2A7M7C7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Skor2A7M7C7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Skor2A7M7C7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Skor2A7M7C7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Skor2A7M7C7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Skor2A7M7C7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Skor2A7M7C7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Skor2A7M7C7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Skor2A7M7C7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Skor2A7M7C7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Skor2A7M7C7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Skor2A7M7C7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Skor2A7M7C7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Skor2A7M7C7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Skor2A7M7C7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Skor2A7M7C7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Skor2A7M7C7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Skor2A7M7C7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Skor2A7M7C7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Skor2A7M7C7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Skor2A7M7C7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Skor2A7M7C7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Skor2A7M7C7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skor2A7M7C7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Skor2A7M7C7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Skor2A7M7C7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Skor2A7M7C7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Skor2A7M7C7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Skor2A7M7C7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Skor2A7M7C7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Skor2A7M7C7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Skor2A7M7C7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Skor2A7M7C7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Skor2A7M7C7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Skor2A7M7C7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Skor2A7M7C7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skor2A7M7C7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Skor2A7M7C7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Skor2A7M7C7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Skor2A7M7C7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Skor2A7M7C7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Skor2A7M7C7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Skor2A7M7C7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Skor2A7M7C7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Skor2A7M7C7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Skor2A7M7C7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skor2A7M7C7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skor2A7M7C7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Skor2A7M7C7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skor2A7M7C7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skor2A7M7C7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skor2A7M7C7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Skor2A7M7C7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Skor2A7M7C7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Skor2A7M7C7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Skor2A7M7C7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Skor2A7M7C7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Skor2A7M7C7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Skor2A7M7C7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Skor2A7M7C7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Skor2A7M7C7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Skor2A7M7C7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Skor2A7M7C7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Skor2A7M7C7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Skor2A7M7C7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Skor2A7M7C7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Skor2A7M7C7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Skor2A7M7C7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Skor2A7M7C7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Skor2A7M7C7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Skor2A7M7C7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Skor2A7M7C7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Skor2A7M7C7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Skor2A7M7C7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Skor2A7M7C7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Skor2A7M7C7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Skor2A7M7C7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Skor2A7M7C7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Skor2A7M7C7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Skor2A7M7C7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms