Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc38A3KMP2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ttc38A3KMP2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc38A3KMP2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc38A3KMP2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc38A3KMP2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc38A3KMP2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc38A3KMP2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttc38A3KMP2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ttc38A3KMP2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc38A3KMP2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttc38A3KMP2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc38A3KMP2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc38A3KMP2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc38A3KMP2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc38A3KMP2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ttc38A3KMP2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ttc38A3KMP2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttc38A3KMP2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc38A3KMP2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc38A3KMP2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc38A3KMP2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc38A3KMP2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc38A3KMP2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc38A3KMP2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ttc38A3KMP2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ttc38A3KMP2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ttc38A3KMP2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ttc38A3KMP2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttc38A3KMP2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttc38A3KMP2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttc38A3KMP2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttc38A3KMP2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc38A3KMP2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc38A3KMP2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc38A3KMP2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttc38A3KMP2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttc38A3KMP2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc38A3KMP2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc38A3KMP2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc38A3KMP2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc38A3KMP2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc38A3KMP2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc38A3KMP2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc38A3KMP2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc38A3KMP2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc38A3KMP2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc38A3KMP2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc38A3KMP2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc38A3KMP2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc38A3KMP2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc38A3KMP2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc38A3KMP2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttc38A3KMP2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttc38A3KMP2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttc38A3KMP2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttc38A3KMP2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttc38A3KMP2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ttc38A3KMP2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ttc38A3KMP2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc38A3KMP2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc38A3KMP2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc38A3KMP2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ttc38A3KMP2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ttc38A3KMP2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ttc38A3KMP2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ttc38A3KMP2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttc38A3KMP2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttc38A3KMP2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttc38A3KMP2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ttc38A3KMP2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ttc38A3KMP2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ttc38A3KMP2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ttc38A3KMP2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc38A3KMP2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc38A3KMP2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc38A3KMP2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc38A3KMP2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc38A3KMP2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc38A3KMP2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc38A3KMP2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc38A3KMP2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc38A3KMP2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc38A3KMP2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc38A3KMP2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc38A3KMP2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc38A3KMP2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc38A3KMP2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc38A3KMP2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc38A3KMP2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc38A3KMP2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc38A3KMP2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc38A3KMP2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc38A3KMP2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc38A3KMP2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc38A3KMP2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttc38A3KMP2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttc38A3KMP2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttc38A3KMP2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc38A3KMP2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms