Protein–RNA interactions for Protein: A2AF28

Slc25a53, MCG115034, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a53A2AF28 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc25a53A2AF28 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc25a53A2AF28 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc25a53A2AF28 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc25a53A2AF28 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc25a53A2AF28 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc25a53A2AF28 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc25a53A2AF28 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc25a53A2AF28 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc25a53A2AF28 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc25a53A2AF28 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc25a53A2AF28 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc25a53A2AF28 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc25a53A2AF28 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc25a53A2AF28 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc25a53A2AF28 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc25a53A2AF28 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc25a53A2AF28 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc25a53A2AF28 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc25a53A2AF28 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc25a53A2AF28 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc25a53A2AF28 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc25a53A2AF28 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc25a53A2AF28 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc25a53A2AF28 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc25a53A2AF28 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc25a53A2AF28 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc25a53A2AF28 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc25a53A2AF28 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc25a53A2AF28 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc25a53A2AF28 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc25a53A2AF28 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc25a53A2AF28 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc25a53A2AF28 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc25a53A2AF28 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc25a53A2AF28 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc25a53A2AF28 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc25a53A2AF28 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc25a53A2AF28 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc25a53A2AF28 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc25a53A2AF28 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc25a53A2AF28 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc25a53A2AF28 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc25a53A2AF28 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc25a53A2AF28 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc25a53A2AF28 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc25a53A2AF28 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc25a53A2AF28 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc25a53A2AF28 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc25a53A2AF28 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc25a53A2AF28 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc25a53A2AF28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc25a53A2AF28 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc25a53A2AF28 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc25a53A2AF28 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc25a53A2AF28 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc25a53A2AF28 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc25a53A2AF28 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc25a53A2AF28 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc25a53A2AF28 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc25a53A2AF28 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc25a53A2AF28 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc25a53A2AF28 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc25a53A2AF28 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc25a53A2AF28 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc25a53A2AF28 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc25a53A2AF28 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc25a53A2AF28 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc25a53A2AF28 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc25a53A2AF28 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc25a53A2AF28 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc25a53A2AF28 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc25a53A2AF28 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc25a53A2AF28 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc25a53A2AF28 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc25a53A2AF28 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc25a53A2AF28 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc25a53A2AF28 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc25a53A2AF28 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc25a53A2AF28 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc25a53A2AF28 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc25a53A2AF28 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc25a53A2AF28 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc25a53A2AF28 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms