Protein–RNA interactions for Protein: A2A9C3

Szt2, KICSTOR complex protein SZT2, mousemouse

Predictions only

Length 3,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szt2A2A9C3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Szt2A2A9C3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Szt2A2A9C3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Szt2A2A9C3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Szt2A2A9C3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Szt2A2A9C3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Szt2A2A9C3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Szt2A2A9C3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Szt2A2A9C3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Szt2A2A9C3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Szt2A2A9C3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Szt2A2A9C3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Szt2A2A9C3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Szt2A2A9C3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Szt2A2A9C3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Szt2A2A9C3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Szt2A2A9C3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Szt2A2A9C3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Szt2A2A9C3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Szt2A2A9C3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Szt2A2A9C3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Szt2A2A9C3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Szt2A2A9C3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Szt2A2A9C3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Szt2A2A9C3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Szt2A2A9C3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Szt2A2A9C3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Szt2A2A9C3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Szt2A2A9C3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Szt2A2A9C3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Szt2A2A9C3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Szt2A2A9C3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Szt2A2A9C3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Szt2A2A9C3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Szt2A2A9C3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Szt2A2A9C3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Szt2A2A9C3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Szt2A2A9C3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Szt2A2A9C3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Szt2A2A9C3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Szt2A2A9C3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Szt2A2A9C3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Szt2A2A9C3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Szt2A2A9C3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Szt2A2A9C3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Szt2A2A9C3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Szt2A2A9C3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Szt2A2A9C3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Szt2A2A9C3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Szt2A2A9C3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Szt2A2A9C3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Szt2A2A9C3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Szt2A2A9C3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Szt2A2A9C3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Szt2A2A9C3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Szt2A2A9C3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Szt2A2A9C3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Szt2A2A9C3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Szt2A2A9C3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Szt2A2A9C3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Szt2A2A9C3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Szt2A2A9C3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Szt2A2A9C3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Szt2A2A9C3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Szt2A2A9C3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Szt2A2A9C3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Szt2A2A9C3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Szt2A2A9C3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Szt2A2A9C3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Szt2A2A9C3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Szt2A2A9C3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Szt2A2A9C3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Szt2A2A9C3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Szt2A2A9C3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Szt2A2A9C3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Szt2A2A9C3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Szt2A2A9C3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Szt2A2A9C3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Szt2A2A9C3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Szt2A2A9C3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Szt2A2A9C3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Szt2A2A9C3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Szt2A2A9C3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Szt2A2A9C3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Szt2A2A9C3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Szt2A2A9C3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Szt2A2A9C3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Szt2A2A9C3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Szt2A2A9C3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Szt2A2A9C3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Szt2A2A9C3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Szt2A2A9C3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Szt2A2A9C3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Szt2A2A9C3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Szt2A2A9C3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Szt2A2A9C3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Szt2A2A9C3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Szt2A2A9C3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Szt2A2A9C3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Szt2A2A9C3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms