Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdc27A2A6Q5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdc27A2A6Q5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdc27A2A6Q5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdc27A2A6Q5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdc27A2A6Q5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdc27A2A6Q5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdc27A2A6Q5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdc27A2A6Q5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc27A2A6Q5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc27A2A6Q5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc27A2A6Q5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc27A2A6Q5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc27A2A6Q5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdc27A2A6Q5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc27A2A6Q5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdc27A2A6Q5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc27A2A6Q5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc27A2A6Q5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc27A2A6Q5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc27A2A6Q5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc27A2A6Q5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc27A2A6Q5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc27A2A6Q5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc27A2A6Q5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc27A2A6Q5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc27A2A6Q5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cdc27A2A6Q5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdc27A2A6Q5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc27A2A6Q5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc27A2A6Q5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc27A2A6Q5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc27A2A6Q5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc27A2A6Q5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc27A2A6Q5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc27A2A6Q5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdc27A2A6Q5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc27A2A6Q5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdc27A2A6Q5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdc27A2A6Q5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdc27A2A6Q5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdc27A2A6Q5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdc27A2A6Q5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdc27A2A6Q5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdc27A2A6Q5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc27A2A6Q5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc27A2A6Q5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc27A2A6Q5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc27A2A6Q5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc27A2A6Q5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc27A2A6Q5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc27A2A6Q5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc27A2A6Q5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdc27A2A6Q5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdc27A2A6Q5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdc27A2A6Q5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdc27A2A6Q5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc27A2A6Q5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc27A2A6Q5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdc27A2A6Q5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdc27A2A6Q5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdc27A2A6Q5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc27A2A6Q5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc27A2A6Q5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc27A2A6Q5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc27A2A6Q5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc27A2A6Q5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdc27A2A6Q5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdc27A2A6Q5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdc27A2A6Q5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdc27A2A6Q5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdc27A2A6Q5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdc27A2A6Q5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdc27A2A6Q5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdc27A2A6Q5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdc27A2A6Q5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdc27A2A6Q5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdc27A2A6Q5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdc27A2A6Q5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdc27A2A6Q5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc27A2A6Q5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdc27A2A6Q5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdc27A2A6Q5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdc27A2A6Q5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdc27A2A6Q5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc27A2A6Q5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc27A2A6Q5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc27A2A6Q5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc27A2A6Q5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc27A2A6Q5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc27A2A6Q5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc27A2A6Q5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc27A2A6Q5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc27A2A6Q5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc27A2A6Q5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc27A2A6Q5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdc27A2A6Q5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdc27A2A6Q5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc27A2A6Q5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms