Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlrp1bA1Z198 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlrp1bA1Z198 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nlrp1bA1Z198 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nlrp1bA1Z198 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nlrp1bA1Z198 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp1bA1Z198 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp1bA1Z198 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp1bA1Z198 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp1bA1Z198 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp1bA1Z198 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp1bA1Z198 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp1bA1Z198 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp1bA1Z198 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nlrp1bA1Z198 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp1bA1Z198 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrp1bA1Z198 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrp1bA1Z198 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrp1bA1Z198 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp1bA1Z198 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp1bA1Z198 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp1bA1Z198 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp1bA1Z198 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp1bA1Z198 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nlrp1bA1Z198 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp1bA1Z198 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp1bA1Z198 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp1bA1Z198 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp1bA1Z198 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp1bA1Z198 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp1bA1Z198 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp1bA1Z198 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp1bA1Z198 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp1bA1Z198 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp1bA1Z198 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp1bA1Z198 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp1bA1Z198 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp1bA1Z198 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp1bA1Z198 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp1bA1Z198 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp1bA1Z198 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp1bA1Z198 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp1bA1Z198 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp1bA1Z198 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp1bA1Z198 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrp1bA1Z198 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrp1bA1Z198 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrp1bA1Z198 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlrp1bA1Z198 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp1bA1Z198 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp1bA1Z198 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp1bA1Z198 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp1bA1Z198 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp1bA1Z198 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp1bA1Z198 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp1bA1Z198 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp1bA1Z198 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp1bA1Z198 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp1bA1Z198 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp1bA1Z198 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp1bA1Z198 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp1bA1Z198 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp1bA1Z198 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp1bA1Z198 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp1bA1Z198 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp1bA1Z198 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp1bA1Z198 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp1bA1Z198 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp1bA1Z198 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp1bA1Z198 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrp1bA1Z198 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp1bA1Z198 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp1bA1Z198 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp1bA1Z198 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp1bA1Z198 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp1bA1Z198 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp1bA1Z198 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp1bA1Z198 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp1bA1Z198 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp1bA1Z198 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp1bA1Z198 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp1bA1Z198 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp1bA1Z198 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp1bA1Z198 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp1bA1Z198 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp1bA1Z198 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp1bA1Z198 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp1bA1Z198 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp1bA1Z198 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp1bA1Z198 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp1bA1Z198 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp1bA1Z198 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp1bA1Z198 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp1bA1Z198 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp1bA1Z198 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp1bA1Z198 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp1bA1Z198 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms