Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms