Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF1Q9Y548 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF1Q9Y548 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF1Q9Y548 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF1Q9Y548 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF1Q9Y548 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF1Q9Y548 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF1Q9Y548 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF1Q9Y548 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF1Q9Y548 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF1Q9Y548 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF1Q9Y548 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF1Q9Y548 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF1Q9Y548 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF1Q9Y548 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms