Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SAMM50Q9Y512 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAMM50Q9Y512 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms