Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms